Los 45 kilómetros cuadrados de su término municipal alternan los terrenos llanos propios del valle donde se asienta, con pequeñas elevaciones y lomas.

Las mayores alturas se hallan en la zona norte, en la Sierra de Mollina. Su vegetación es típicamente mediterránea aunque gran parte de sus tierras se utilizan para fines agrícolas y ganaderos.

Dentro de las rutas de senderismo, se encuentran dos interesantes recorridos para conocer la riqueza natural del término municipal de Alcalá del Valle:

- Ruta ecológica de la vertiente oriental de la Sierra de Mollina

- Ruta siguiendo el curso del río Aguililla; desde su parte oriental hasta la zona denominada "paso de los leñadores", donde se une al río Corbones.