Foto: © José Mª. Collantes González Capilla del Sagrario

La Capilla de la Virgen de los Milagros, contiene un retablo barroco del primer tercio del siglo XVII, de la escuela de Pedro Duque Cornejo. En la hornacina central se encuentra la imagen de la patrona de la ciudad, escultura posiblemente del siglo XIII, aunque con algunas reformas posteriores.

En la Capilla del Sagrario, el retablo de plata mexicana, realizado en 1682 por el platero José Medina, en San Luis de Potosí (Mexico) y donado a la iglesia por Juan Camacho Jaina. A finales del siglo XIX se sustituyó el águila que lo remataba por la actual corona. En la misma capilla destaca el angel lamparero, obra escultórica de extremado barroquismo atribuida a Luisa Roldán, "La Roldana".

Destacan también entre otras piezas de interés la Sillería del Coro, de Juan Bautista Vázquez "El joven", y dos órganos del s. XVIII.