Foto: © Archivo CadizNet Planta del Castillo de Santa Catalina

El importante valor estratégico que el castillo tuvo históricamente se perdió con el paso del tiempo. Por ello, en épocas recientes se diseñaron para él otros usos. En 1987, el general gobernador militar de la plaza D. Joaquín Villalba presentó el proyecto de creación en el Castillo de Santa Catalina del Centro Cultural Cristóbal de Rojas, en el que se pretendía albergar el Aula Militar de Cultura, la Biblioteca y Cartoteca del Gobierno Militar, un Museo Militar dedicado a asedios y ataques sufridos por Cádiz, salas de investigadores y reprografía, etc.

En 1991 el Ministerio de Defensa dejó de hacer uso del castillo. Estuvo un tiempo abandonado, y tal vez por esa razón desapareció una preciosa imagen de Santa Catalina en forma de mosaico que estaba colocada sobre un pórtico interior del castillo.